自治州的黑色金属矿以铁为主，其次是锰、钒、钛。铁矿分布较广，储量多，品位高，开采利用率也高。全州共发现铁矿55处，其中矿床8处，矿点47处。

一、普昌钒钛磁铁矿

位于阿图什市普昌以北14千米处，有5个较大的矿体，矿体总面积8.45万平方米，据钻探证明矿体埋深100米以下。矿体分布形状和水文地质简单，部分地区可以露天开采和井下开采，且交通方便，有工业开发的前景。矿石矿物主要为磁铁矿、钛铁矿，其次为磁赤铁矿、硫铁矿、黄铜矿，伴生钴、镍、铬、锡等稀有元素。

二、红山铁矿

红山铁矿位于乌恰县乌鲁克恰提乡西15千米处，紧傍国防公路，交通方便。

本矿区属热液型铁矿，为古生代、中生代地层发育。共有8个矿带，23个矿体，分布在南北长10千米，东西宽2千米的范围之内。矿石总含量624.8万吨，

三、苏巴什铁矿

苏巴什铁矿位于阿克陶县布伦口乡苏巴什村，中巴公路212千米处，矿点海拔4 000米，有简易公路直达矿区。由大小不等的七个矿体组成，各矿体均属磁铁矿，矿体含铁量高，并伴有镍、钴、银、锌。合计含量48.78万吨。

四、肖尔布拉克铁矿点

位于阿克陶县奥依塔克乡西北5千米处，此矿为矽卡岩型铁矿床，产于二叠纪灰岩中，矿床由大小21个矿体组成。矿石矿物主要为磁铁矿，其次为赤铁矿、镜铁矿及少量黄铁矿。含量约1万吨，属小型矿点。

五、切列克其铁矿

位于阿克陶县布伦口乡境内，矿区构造十分简单，地层总体为单斜层，矿体与围岩同步褶皱，界线清楚，矿体走向近东西。砂石物主要为菱铁矿，矿石品位较高，均属1级富矿。

六、“二○八”铁矿

位于阿克陶县苏巴什大队，在中巴公路208千米处，因此称208矿。交通方便，便利开采。矿体为层状，共分两层，矿体断续延长2千米。矿石以磷铁矿和赤铁矿为主，其次为褐铁矿，矿石中伴生微钡、钴、铜。矿石总储量49.74万吨。

七、大乌鲁赤铁矿

位于阿合奇县喀拉布拉克乡，距县城181千米，有简易公路直达矿点。矿体呈透镜产于石英斑岩中，属沉积型铁矿。矿体长约120米，最厚达5.5米，平均2.5米。主要为赤铁矿，矿石储量40.8万吨，在矿区周围还有同类矿床多处。

八、开孜维克铁锰矿

矿区位于大乌鲁赤铁矿附近，*近国防公路，交通运输方便。属沉积型铁矿，矿石主要是硅质锰矿、铁锰矿、赤铁矿，矿体属不稳定型。批准储量锰矿0.3万吨，铁矿石9.2万吨。

在别迭里河下游，阿合奇境内有锰矿，是以含锰石英方解石细脉产出。虽然有资源存在，但均无工业开采价值。钒钛地质含量分别为5.65万吨和182.6万吨，但地质工作不够，工业开采还不具备条件。