自治州化工原料矿以盐为主，其次为黄铁矿，现已被开采利用，虽然盐仅供食用，尚未形成盐化工工业，但已有制纯碱、水泥生产配料等工业用盐。磷虽有一定储量，但因品位不高没有开采利用。蛇纹石矿、黄铁矿、硫矿也有分布。

一、盐

自治州盐资源十分丰富，计有8个盐矿，2个矿点，其中以哈拉峻的硝尔库勒和吐孜苏盖提两个湖盐矿最为著名。

肖尔库勒盐矿

位于阿图什市东北哈拉峻乡，为第四纪化学沉积形成的湖盐矿床。肖尔库勒和吐孜苏盖提两湖相连，共处于封闭式山间盆地最低处，四周山体的地表水都汇集湖中，各地层盐类冲积湖中沉积，水分蒸发即形成现代湖盐的矿床，这种成矿过程现今仍在继续。

盐湖面积90平方千米，盐矿层厚20～30厘米，主要为中粒结构的结晶盐，味咸质纯，灰白色，主要成分为氯化钠，含量在94％以上。矿石储量1 040万吨，折合氯化钠977.6万吨。谈矿伴生钾盐0.07～0.51％，氧化硼0.33～0.17％，还含有银、锂等元素。氧化锂含量较高，一般为0.05～4％，最高可达5.94％，具有工业利用价值，可以综合开发利用。

吐孜苏盖提盐矿

与肖尔库勒盐湖相通，距离10余千米，盐泽面积50多平方千米，盐盖层20～30厘米，向下即为粗晶盐层，厚度为30～60厘米，是主要开采部分。含氯化钠94.4％，地质储量980万吨，折纯氯化钠921．02万吨，但实际储量还要超过此数。除氯化钠外还有钙0.39％，镁0.01％。

两矿除供阿图什盐厂生产食盐供应南疆各地外，还向黑孜苇水泥厂提供工业用盐。

沙曼盐矿

沙曼盐矿在阿克陶县巴仁乡的汗铁列克村，有简易公路，交通方便。盐矿共有3层，第一层和第二层盐矿层之间夹有4～6米石膏透镜体，矿体长度约150米，厚度1～33米。第三层盐矿层延长200米，厚11米，总储量54.6万吨。

喀拉塔勒盐矿

位于乌恰县城至乌鲁克恰提乡政府公路旁，紧临公路，交通方便，距康苏矿区40千米。岩盐矿体地表出露很少，含盐层约400米，盐岩层多不稳定，呈透镜状或鸡窝状产出，其规模不大，最大的长50米，厚5米。矿平均含岩盐体80％，泥质与石膏20％。岩盐质量好，无色透明，无苦辣味。

除上述盐矿外，在阿克陶还有康帕吐斯岩盐矿，储量3.5万吨。

二、芒硝

芒硝矿在阿图什市区东北10余千米处，矿床类型为土食盐—芒硝矿床，矿体的围岩为第四系洪积层。食盐、芒硝产于砂质土层中，形成硬壳，厚10～15厘米，分布面积约1千米，长几十千米，主要成分为碱、盐和芒硝。

三、磷

乌恰县磷矿

位于乌恰县县城东南。矿体为层状，矿区只见一个层位，层位稳定，厚度变化不大，厚0.6～2米，由西向东逐渐增厚，最厚处可达2米，含矿地层在矿区内约长1400米。五氧化二磷平均品位4.9％，水选后品位可达15～17％，可利用制造磷粉、钙磷肥，地质储量14.1万吨。

乌拉根磷矿

位于乌恰县境内，矿床分两层，上层比较稳定，成层状产出。矿体长7.83千米，厚0.5～1.2米。矿石为含磷生物碎屑泥灰岩，五氧化磷含量1.03～4.92％，有效磷含量1～2％，最低0.98％，最高2.48％，地质储量197.4万吨，下层储量未测。

四、蛇纹石矿

阿合奇县喀拉布拉克齐齐加那克地方有蛇纹石矿，属于超基性蛇纹岩矿床，共有6处矿体，其中最大矿体长1.9千米，宽80～135米，其余5处长150～500米，宽60～100米。矿石矿物主要为纤维蛇纹石及部分叶蛇纹石组成，并含有微量的镍和铬。蛇纹石品位高，质量好，一般均超过工业要求，地质储量在300万吨以上，属中型矿床，具有较高的工业开采价值。

五、黄铁

乌瓦黄铁矿　矿区由5个矿体组成，最大的长120米，厚1～2米。铁矿品位40％，并与金、铜等元素密切共生。金在矿脉含量不均，地表风化带含量0.08～0.16克／吨，细粒黄铁矿聚集中金含量31.96克／吨，细—中粒黄铁矿含金量达14.56％。还有铅、锌、锑、砷、汞、钡、锆等元素，含硫量平均16～23.1％。储量：黄铁矿64.37万吨，磁铁矿1 700吨。

卡斯卡苏黄铁矿

位于乌恰县波斯坦铁列克乡，为中温热岩充填交替矿床。分上下两层矿体，上层长120米，平均厚3.59米，下层长100米，平均厚4.25米。矿石可分为浸染状和致密状，主要为自然硫、褐铁矿、黄钾铁钒矿，硫平均品位12％，黄铁矿储量4.992万吨。

乌依塔什黄铁矿

位于乌恰县波斯坦铁列克乡，为中温热岩交替型，矿体成层状，长245米，宽90米，平均厚度1.17～2.05米。主要矿物为黄铁矿，C１级储量8.74万吨，C２级储量0.36万吨。并含有少量铜、铅、锌、银、镓、钼等元素，铜含量0.15～0.3％，局部达1％，最高可达5％，银的含量0.0005～0.003％，最高达5％。

六、自然硫

州境内自然硫矿不多，且储量少，地质工作不够，据初步查清的有阿克陶奎克自然硫矿，矿体产于石膏层中，呈不连续的浸染体。矿体长100米，厚0.2～0.5米，品位约20～30％。

此外在阿克陶苏巴什地区也有硫矿，储量不清。